基因排列可视化(基因重排图)

用于展示基因排布及基因重排,支持区分正负链及非编码区的可视化

第一步:导入基因排列文件
📌 文件格式说明
• "#" 开头的行为注释行,只显示文字不定义排布,可以用于物种分类注释
• 除了注释行,第一列是拉丁名,其余各列为基因名称,不同列之间以制表符(TAB)隔开,在EXCEL中直接复制出来的就是这个格式
• 在基因名称前可以标注“-”代表编码于负链;标注“:”标识该基因缺失,多个符号可以混合标注
• 标注“!”的名称代表非编码区
• 如果你把所有基因都不标注为负链,那么或许你可以得到一个线性的排布图
• 如果你对画出来的间距不满意或者图片超过画布,可以使用Adobe Illustrator编辑SVG
• 你可以点击“加载示例”查看导入的格式
第二步:设置呈现类型
📌 预设四种类型(不可删除)单字母tRNA(形如:A、K等单字母tRNA编码基因) | 带编号tRNA(形如:S1、L2等带数字的tRNA基因) | 长蛋白/rRNA | 短蛋白(如atp8的序列相对于其他基因短得多)
➕ 自定义类型
💡 预设类型有内置自动分配规则(cox1、cox2、nad1以及atp8 等蛋白基因自动归为类型3宽斜体);短蛋白及自定义类型需手动在第三步分配。
第三步:为基因分配类型
基因名称
分配类型
标识
暂无基因,请先导入文件
第四步:绘图参数
第五步:SVG 预览与导出
等待生成...